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Spoligotyping – una alternativa de Southern blot

.Spoligotyping resultado

Spoligotyping es un método basado en PCR a detección y tipificación de bacteria de Mycobacterium/Tuberculosis complejo. Spoligotyping, que utiliza RLB (Reversed Line Blotting), que es una alternativa de Southern Blot cuando necesite resultados rápidos. El método es útil para detectar y escribir el complejo de M. tuberculosis bacterias en muestras clínicas. El nivel de diferenciación de spoligotyping es menos compardo que perfiles de bandas de ADN (copias de IS6110) cuando son cinco o más y mejor para menos de cinco copias de IS6110. El método de Spoligotyping es preferido para escribir cadenas de M. bovis, que generalmente contienen sólo una o dos copias de IS6110.

La clave del método está en la estructura del AND del complejo del Mycobacterium tuberculosis, esta bacteria tiene un polimorfismo del ADN que está conocido por el región de “Direct Repeat” (DR). Este región es un locus que es único a complejo del Mycobacterium tuberculosis. Este región es descuprido por Hermans et al. en Mycobacterium bovis BCG y gracias a él los cientificos han descubrido la vacuna de tuberculosis. El DR región de M. bovis BCG es presentado en 36 pars de bases que está interclado en un espaciador de ADN no repetido. Cada espaciador tiene la longitud entre 35 y 41 pars de bases. El número en M. bovis BCG de las copias de la consecuencia de DR es 49. En el complejo del Mycobacterium tuberculosis este número varia mucho. La mayoría de los bacterias Mycobacterium tuberculosis contienen la cadena de IS6110 en el DR región.

 

spoligotyping

Figura 1. La estructura del locus DR en el genoma de M. tuberculosis H37Rv y M. bovis BCG P3. Los rectángulos verdes representan el 36 pb Direct Repeat (DR).

 

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